Funkcija izolatora je usmjerena, kao što je otkriveno u eksperimentima s voćnim mušicama. gypsy je umetnut u žuti lokus y Drosophila melanogaster, što je rezultiralo inaktivacijom y gena u nekim tkivima, ali je y gen još uvijek bio aktivan u nekim tkivima, jer je na jednom kraju gipsa postojala sekvenca izolatora. gypsy će imati različite efekte na aktivnost gena kada se gypsy ubaci na različite lokacije u y lokusu. To je zato što aktivnost y gena reguliraju četiri pojačivača. Kada se izolator ubaci neposredno uzvodno od promotora, on blokira aktivaciju gena u lopatici krila i tkivima kutikule tijela (od uzvodnog pojačivača). Ali nije blokirao ekspresiju y gena (iz nizvodnog pojačivača) u čekinjama i farzalnim kandžama.
Pošto su neki pojačivači uzvodno, a neki nizvodno od promotora, efekat izolatora ne zavisi od položaja izolatora u odnosu na promotor. Stoga, razlog za usmjerenost efekta izolatora nije stvarno shvaćen. Utvrđeno je da dva lokusa utiču na funkciju izolatora na način transaktivacije. Nukleoprotein kodiran genom S2J(Hw) prepoznaje izolator i tek nakon što se izolator veže za njega ima izolacijski učinak. Kada je ovaj gen mutiran, efekat izolacije se gubi uprkos umetanju izolatora u y lokus, a y se izražava u svim tkivima. Drugi lokus je mod(mdg 4). Nakon mutacije ovog gena, njegov učinak je upravo suprotan od Su(Hw), odnosno ovi mutanti pojačavaju izolacijski učinak, čineći da izolacijski učinak izolatora više nije usmjeren i da se širi, odnosno blokira djelovanje pojačivača na oba uzvodne i nizvodne strane.
